Dari nomor rekening dan ponsel, terlacaklah posisi Zubair, tangan kanan Hambali yang kemudian tertangkap pada Juli 2003. Zubair dibekuk saat hendak menyeberang ke luar Thailand.
Baca juga: Jabat Presiden, Joe Biden Akhiri Larangan Negara Muslim Masuk Amerika
Beberapa minggu kemudian, sosok yang menemani pelarian Hambali, Lillie, tertangkap di Bangkok saat hendak mengurus perpanjangan paspor palsu milik bosnya.
Ketika bersembunyi di Thailand, Hambali memang memakai paspor Pakistan.
Sama seperti Zubair, Lillie menolak untuk bekerjasama. Berdasarkan laporan The Nation pada 21 Agustus 2003, ternyata tanpa harus mengorek informasi dari Lillie, secara beruntung polisi Thailand menemukan sebuah kunci kamar Apartemen Boon Yarak di Ayutthaya, kota wisata 75 kilometer dari Bangkok.