Ditambahkan Panji Kumoro, Masjid Syuhada ini termasuk salah satu pionir arsitektur masjid modern di Indonesia. "Bangunan masjid ini sudah dibuat bersekat dan digunakan sesuai dengan fungsinya masing-masing," terangnya.
Masjid yang menggabungkan berbagai arsiktektur -- selain sejumlah perlambang melekat dalam setiap bangunan -- di kubahnya mengambil bentuk-bentuk bangunan yang berkembang di Persia, India dan menjadi bagian dari masjid-masjid yang dibangun ketika itu. Kubah bundar di bagian tengah sebagai kubah utama, dikelilingi kubah kecil di empat sudutnya.
Adanya 17 anak tangga menuju ruang utama, gapura berbentuk segi delapan di depan masjid serta kubah pertama berjumlah empat dan kubah atas berjumlah lima, menunjukkan Hari Kemerdekaan Indonesia, yaitu 17 Agustus 1945.
Selain simbol nasionalis, bangunan dengan 3 lantai ini juga menyisipkan simbol Islam, seperti 20 ventilasi di ruang bawah yang menandakan 20 sifat Allah SWT, enam jendela di ruang salat pria sebagai rukun iman, lima ventilasi tempat khusus imam simbol Rukun Islam, dan dua tiang penyangga di mushola putri sebagai simbol dua keyakinan untuk menyeimbangkan kepentingan duniawi dan ukhrawi (akhirat).
Kini, Masjid Syuhada sudah dilengkapi dengan bangunan pendukung seperti perpustakaan hingga lembaga pendidikan formal sejak dari TK, SD, SMP dan perguruan tinggi. Bahkan juga memiliki lembaga zakat, lembaga keuangan serta koperasi yang dikelola secara mandiri.