Di dalam beberapa kasus, memiliki ibu kota terpisah-pisa dapat meningkatkan ketegangan antar wilayah. Adanya pusat-pusat kekuasaan yang terpisah bisa menjadi sumber perselisihan politik dan sosial antar daerah.
Ketidakpraktisan Logistik
Koordinasi antara ibukota yang terpisah bisa menjadi tantangan logistik, terutama dalam situasi darurat atau krisis nasional. Transportasi dan komunikasi antar wilayah mungkin tidak seefisien jika dibandingkan dengan sistem yang terpusat.
Meskipun memiliki kelebihan, model dengan ibukota terpisah adalah pilihan yang kompleks dan tergantung konteks sejarah, politik dan geografis dari masing-masing negara. Upaya mengatasi kekurangan sepenuhnya tergantung kepada kemauan politik yang konsisten dan konsekwen atas keputusan yang telah diambil. (*)